Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms