Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms