Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms