Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms