Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP4E1Q9UPM8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP4E1Q9UPM8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms