Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HDAC6Q9UBN7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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HDAC6Q9UBN7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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