Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GKN1Q9NS71 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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