Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms