Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms