Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSPNQ9HAW4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms