Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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