Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms