Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms