Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB11FIP5Q9BXF6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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