Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF25Q9BQ70 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms