Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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