Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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