Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms