Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms