Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms