Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDAC11Q96DB2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC11Q96DB2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC11Q96DB2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC11Q96DB2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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