Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms