Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EDAQ92838 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDAQ92838 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDAQ92838 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms