Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms