Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms