Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms