Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT1

TTC30A, Tetratricopeptide repeat protein 30A, humanhuman

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC30AQ86WT1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC30AQ86WT1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TTC30AQ86WT1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TTC30AQ86WT1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC30AQ86WT1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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