Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms