Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms