Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms