Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 463.4 ms