Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms