Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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