Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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