Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FAM187BQ17R55 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FAM187BQ17R55 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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