Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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