Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDR2Q16832 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms