Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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