Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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SIX1Q15475 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SIX1Q15475 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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