Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms