Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIDRQ14159 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIDRQ14159 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIDRQ14159 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPIDRQ14159 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPIDRQ14159 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPIDRQ14159 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms