Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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