Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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