Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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CUL3Q13618 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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CUL3Q13618 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CUL3Q13618 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL3Q13618 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL3Q13618 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL3Q13618 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL3Q13618 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL3Q13618 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL3Q13618 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL3Q13618 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL3Q13618 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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