Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA5AQ13591 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms