Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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