Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms