Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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