Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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