Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXF1Q12946 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXF1Q12946 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXF1Q12946 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXF1Q12946 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXF1Q12946 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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